铁路交通

新西伯利亚市的诞生与铁路息息相关，因为这座城市是由于建造西伯利亚铁路才形成的。当决定将横跨鄂毕河的桥梁建造得比原计划更靠南时，鄂毕河站产生了，随后发展成新尼古拉耶夫斯克，也就是现在的新西伯利亚。

西伯利亚铁路连接俄罗斯欧洲部分、乌拉尔、西伯利亚和远东、俄罗斯西边、北边和南边的港口，并且连接到欧洲的铁路通路和太平洋港口和到亚洲铁路通路。

新西伯利亚市是西西伯利亚铁路的中心。2017年西西伯利亚铁路的货物装载量为3.069亿吨，相比2016年增长了7.1%。货物装载量在过去的25年前所未有。

新西伯利亚州大型火车站：

•  火车枢纽站 新西伯利亚总站
• “英斯卡娅”转运站 
• “科列希哈”转运站
• 共有约250个站

航空交通

新西伯利亚国际机场（托尔马切沃机场）距离新西伯利亚市中心以西17公里。

托尔马切沃机场是发展最迅速的联邦机场之一，是乌拉尔以东连接欧亚主要航线的的最大的交通枢纽。新西伯利亚机场的地理位置允许服务连接北美洲和亚洲有前途的跨极航线。

由于其优越的地理位置和广泛的航线网络，托尔马切沃机场传统上为大量乘客提供服务，不仅来自新西伯利亚州，还来自附近地区 - 托木斯克、克麦罗沃地区、阿尔泰边疆区和阿尔泰共和国。

新西伯利亚国际机场（托尔马切沃机场）的现代化机场航站楼能够在国内航线上每小时为1800名乘客提供服务，在国际航线上为1300名乘客提供服务。

根据总运输线，托尔马切沃机场位于俄罗斯五大机场之列，仅次于莫斯科以及圣彼得堡机场。截至2017年底，装运货物和邮件量达29441吨（与2016年相比增加了18％）。

截至2017年底，托尔马切沃机场被第四届 “俄罗斯空中大门”全俄奖评为“最佳货运站”获奖者。

汽车交通

新西伯利亚州的领土穿过如下联邦高速公路：

• Р-254“额尔齐斯”（车里雅宾斯克 - 库尔干 - 鄂木斯克 – 新西伯利亚）
• Р-255 “西伯利亚”（新西伯利亚 — 克麦罗沃 — 克拉斯诺亚尔斯克 — 伊尔库茨克），
• Р-256 “丘亚公路”（新西伯利亚 — 比斯科 — 戈尔诺-阿尔泰斯克 — 与蒙古边境 ）

新西伯利亚州公共道路地域网络长度为12732.897公里，其中硬面道路为10332.061 公里。

近年来新西伯利亚州公路运输业最大的项目如下：布格林斯基桥（170亿卢布）、新西伯利亚的北绕道（156亿卢布）、巴雷什沃和科利佐沃居民点中间的隧道和道路（7.699亿卢布）的建筑。